RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PS29 197 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM129A0AVI4 362 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CASKO14936 926 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 PGRMC2O15173 223 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LIMS3P0CW19 117 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LIMS4P0CW20 117 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R38P59533 333 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 CD83Q01151 205 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP2Q05923 314 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TPBGQ13641 420 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 MLC1Q15049 377 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 METRNLQ641Q3 311 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 RDH10Q8IZV5 341 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF31Q96EP0 1072 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 COX14Q96I36 57 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD6Q96NE9 622 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 EQTNQ9NQ60 294 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R7Q9NYW3 318 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 MID1O15344 667 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LATO43561 262 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LALBAP00709 142 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTM3P21266 225 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM31Q5JXX7 168 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM107Q6UX40 140 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.53■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 SUN3Q8TAQ9 357 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ENKURQ8TC29 256 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ZG16BQ96DA0 208 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 PCBD2Q9H0N5 130 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM245Q9H330 911 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF121Q9H920 327 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS16Q9NQE7 514 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 GDE1Q9NZC3 331 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD34BA5PLL1 514 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 LRIT2A6NDA9 550 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 UBXN7O94888 489 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35G4P0C7Q5 338 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 GLCCI1Q86VQ1 547 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 AP3S1Q92572 193 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 FERD3LQ96RJ6 166 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 GDF15Q99988 308 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TMED9Q9BVK6 235 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D17Q9HA65 648 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL2L10Q9HD36 194 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
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SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf51C9J302 202 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MAN2B1O00754 1011 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NCR1O76036 304 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMP2P13473 410 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DRD2P14416 443 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 PDGFRLQ15198 375 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MINDY4Q4G0A6 757 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM52BQ4KMG9 183 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF628Q5EBL2 1059 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4F15Q8NGB8 312 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A2Q96QD8 506 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MED18Q9BUE0 208 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HDHD5Q9BXW7 423 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CLCA2Q9UQC9 943 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRA5P31644 462 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD17B2P37059 387 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RY2P41231 377 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK3Q00526 305 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 INSL4Q14641 139 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF311Q5JNZ3 666 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC30A6Q6NXT4 461 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 VRK2Q86Y07 508 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 FAIM2Q9BWQ8 316 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CD93Q9NPY3 652 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA4GQ9NTN9 838 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 ERI3O43414 337 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 HPGDSO60760 199 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 DMPKQ09013 629 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9A5Q14940 896 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CNIH2Q6PI25 160 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 RRM2BQ7LG56 351 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-202ENST00000417536 NT5DC2Q9H857 520 aa17.51■□□□□ 0.39
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