RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52E6Q96RD3 313 aa21.88■■□□□ 1.09
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UBE2E3-202ENST00000410062 DOHHQ9BU89 302 aa21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TTTY12Q9BZ98 90 aa21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKUB1A6NFN9 424 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM166BA8MTA8 275 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TFECO14948 347 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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UBE2E3-202ENST00000410062 CASP3P42574 277 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 RFX3P48380 749 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 PRIM2P49643 509 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 STX1BP61266 288 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 RPP38P78345 283 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXO1Q12778 655 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 DUSP5Q16690 384 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 RILPQ96NA2 401 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 METTL7AQ9H8H3 244 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 GPATCH2Q9NW75 528 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TTC36A6NLP5 189 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 DECR1Q16698 335 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 MOAP1Q96BY2 351 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC115Q96NT0 180 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ANGPTL4Q9BY76 406 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 SEC14L3Q9UDX4 400 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 BTNL2Q9UIR0 455 aa21.87■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCB7O75027 752 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 GLSO94925 669 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 UNC5CO95185 931 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 IL6P05231 212 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ALOX5P09917 674 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 PNLIPRP2P54317 469 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNK10P57789 538 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 PPIAP62937 165 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TBCELQ5QJ74 424 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 CGB2Q6NT52 195 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ZGRF1Q86YA3 2104 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52N2Q8NGI0 321 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 STON2Q8WXE9 905 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TMCO6Q96DC7 493 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR137Q96N19 417 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 INPP5KQ9BT40 448 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.86■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP4B1P13584 511 aa21.85■■□□□ 1.09
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UBE2E3-202ENST00000410062 CDC73Q6P1J9 531 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 GFRALQ6UXV0 394 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 GALNT10Q86SR1 603 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 PANX1Q96RD7 426 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ACTRT3Q9BYD9 372 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 GALNT9Q9HCQ5 603 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 KLRF1Q9NZS2 232 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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UBE2E3-202ENST00000410062 C2orf72A6NCS6 295 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 PRAMEF25A6NGN4 478 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC3CA6NJW4 275 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ACOT7O00154 380 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ASNA1O43681 348 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNH1O95259 989 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 IL33O95760 270 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 IGKV1D-16P01601 117 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 PTGDSP41222 190 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 CDKN2CP42773 168 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 BHLHB9Q6PI77 547 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A16Q86VW1 577 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM251Q8N6I4 163 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 COX18Q8N8Q8 333 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 CDS1Q92903 461 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 VPS33AQ96AX1 596 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 DEFB127Q9H1M4 99 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 ZFP64Q9NPA5 681 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.84■■□□□ 1.09
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UBE2E3-202ENST00000410062 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM234BA2RU67 622 aa21.83■■□□□ 1.09
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