RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317896.11

HFE-202, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HFE, Length 1,922 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-202ENST00000317896 MVB12BQ9H7P6 319 aa13.14□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 MCUBQ9NWR8 336 aa13.14□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 GDE1Q9NZC3 331 aa13.14□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SIT1Q9Y3P8 196 aa13.14□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ISM1B1AKI9 464 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RFPL3O75679 317 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 GABRR2P28476 465 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 PDHA2P29803 388 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 EFNB1P98172 346 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 HSPB3Q12988 150 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 FLYWCH1Q4VC44 716 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ACSM5Q6NUN0 579 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 PARM1Q6UWI2 310 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ZER1Q7Z7L7 766 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 MRGPREQ86SM8 312 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 CMTM8Q8IZV2 173 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SYT14Q8NB59 555 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 OR4D11Q8NGI4 311 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 FGF11Q92914 225 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 FGF14Q92915 247 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RAB8BQ92930 207 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 UPRTQ96BW1 309 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 KCNJ15Q99712 375 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TM9SF2Q99805 663 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 HDHD2Q9H0R4 259 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 PELI2Q9HAT8 420 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 MALT1Q9UDY8 824 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 A0A0X1KG70 313 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 CASC3O15234 703 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 DHFRP00374 187 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 HK1P19367 917 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TALDO1P37837 337 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 FRKP42685 505 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SLC1A3P43003 542 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 CCT3P49368 545 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 MLC1Q15049 377 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 CFAP206Q8IYR0 622 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 GHDCQ8N2G8 530 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 OR52N1Q8NH53 320 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 NEIL3Q8TAT5 605 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SLC9A6Q92581 669 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 PIGUQ9H490 435 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 NINQ8N4C6 2090 aa13.13□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SMIM30A4D0T7 59 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 M0R3H8 397 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 LEFTY2O00292 366 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 GABRPO00591 440 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SHOXO15266 292 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SEMA7AO75326 666 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RHOP08100 348 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ELFN1P0C7U0 828 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 LIMS3P0CW19 117 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 LIMS4P0CW20 117 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TIMP2P16035 220 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 OPRD1P41143 372 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 CDH11P55287 796 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TAP2Q03519 686 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 ASCL5Q7RTU5 278 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 HDDC2Q7Z4H3 204 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 MORN4Q8NDC4 146 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 OR2A12Q8NGT7 310 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 AIF1LQ9BQI0 150 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 MED28Q9H204 178 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 KCNN2Q9H2S1 579 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 SPNS1Q9H2V7 528 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RHBGQ9H310 441 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 OR51I1Q9H343 314 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 EMC7Q9NPA0 242 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TRPC4Q9UBN4 977 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 CDH10Q9Y6N8 788 aa13.12□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 NNMTP40261 264 aa13.11□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 AVPR1BP47901 424 aa13.11□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 STARD6P59095 220 aa13.11□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 TSPAN31Q12999 210 aa13.11□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 P2RY14Q15391 338 aa13.11□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 LYPD8Q6UX82 237 aa13.11□□□□□ -0.31
HFE-202ENST00000317896 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms