RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297661.8

UBAP1-201, Transcript of ubiquitin associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBAP1, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1-201ENST00000297661 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MYNNQ9NPC7 610 aa14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 THSD1Q9NS62 852 aa14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TAC3Q9UHF0 121 aa14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.67□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PLPP1O14494 284 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PPM1DO15297 605 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 IFNA7P01567 189 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ARAFP10398 606 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PCSK2P16519 638 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MAP2K6P52564 334 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 EPHA5P54756 1037 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF91Q05481 1191 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF77Q15935 545 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RIT1Q92963 219 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ARRDC3Q96B67 414 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SLC6A18Q96N87 628 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 H3BN98 237 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 B4GALT2O60909 372 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PPM1BO75688 479 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 IFNA16P05015 189 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 C6P13671 934 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 DGKGP49619 791 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZMYND11Q15326 602 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 BICRALQ6AI39 1079 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FBXW5Q969U6 566 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 NUS1Q96E22 293 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TMEM19Q96HH6 336 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 NLNQ9BYT8 704 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.66□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 C5orf58C9J3I9 102 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PRRT4C9JH25 899 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SERPIND1P05546 499 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SSTR2P30874 369 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LIMS1P48059 325 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SLC6A11P48066 632 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ETV1P50549 477 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RBBP4Q09028 425 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 BAMBIQ13145 260 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TMEM107Q6UX40 140 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 AMER3Q8N944 861 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TMEM163Q8TC26 289 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 COQ10AQ96MF6 247 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MED18Q9BUE0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LRRK1Q38SD2 2015 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TSPAN11A1L157 253 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SGK494L7N484 410 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 OR10H3O60404 316 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MPC2O95563 127 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CPEP16870 476 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 HK1P19367 917 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 EVX1P49640 407 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 DHCR24Q15392 516 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 REEP3Q6NUK4 255 aa14.65□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms