RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 SOD1P00441 154 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ALPPP05187 535 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ALAS2P22557 587 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 GPR50Q13585 617 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 HYAL4Q2M3T9 481 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB134Q4QY38 66 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 FIGNL1Q6PIW4 674 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF793Q6ZN11 406 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 KIF18BQ86Y91 864 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D19Q8N5T2 526 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 NUP43Q8NFH3 380 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ALG5Q9Y673 324 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC72A6NJI9 287 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SNTNA6NMZ2 147 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 CCL5P13501 91 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 PPM1AP35813 382 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00299Q6ZSB3 139 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 OR4N4Q8N0Y3 316 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ACOT4Q8N9L9 421 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SLC16A11Q8NCK7 471 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 OR2L2Q8NH16 312 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A46Q96AG3 418 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ORAI1Q96D31 301 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 TEX12Q9BXU0 123 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0G2JMP0 313 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0X1KG70 313 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 GCGRP47871 477 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 HMGA2P52926 109 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 TAS2R38P59533 333 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SGCGQ13326 291 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 PDE7AQ13946 482 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 NNATQ16517 81 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 Q5BKY6 102 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 BCL2L15Q5TBC7 163 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 OR4M2Q8NGB6 313 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 PIGXQ8TBF5 258 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 HMGB4Q8WW32 186 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SLC7A6Q92536 515 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SAGE1Q9NXZ1 904 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa12.59□□□□□ -0.39
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PR48 441 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PRG6 482 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 C12orf71A8MTZ7 269 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 ASGR2P07307 311 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 YES1P07947 543 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TALDO1P37837 337 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFA5Q16718 116 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 CAMKMTQ7Z624 323 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 VWA5B2Q8N398 1253 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 RAB42Q8N4Z0 105 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 LINC01555Q8NAE3 123 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 UXS1Q8NBZ7 420 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 LMLNQ96KR4 655 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 IFT27Q9BW83 186 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 SPHK1Q9NYA1 384 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 SLC7A7Q9UM01 511 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3LB9A6J9 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 PLA2G10O15496 165 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3HP0C7X1 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 MYOGP15173 224 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 SHC1P29353 583 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 HYAL2Q12891 473 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC58Q4VC31 144 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 HOMEZQ8IX15 550 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 HDDC3Q8N4P3 179 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 AP3S1Q92572 193 aa12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TMOD1-201ENST00000259365 ZBP1Q9H171 429 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms