RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	REM1	O75628	298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CTAGE8	P0CG41	777 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CT45A8	P0DMV1	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CT45A9	P0DMV2	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TSPAN8	P19075	237 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CHM	P24386	653 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CCKAR	P32238	428 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ALDH9A1	P49189	494 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	DIO3	P55073	304 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CORO7	P57737	925 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	GAB1	Q13480	694 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	VWA1	Q6PCB0	445 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	P3H2	Q8IVL5	708 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	STARD4	Q96DR4	205 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SLC35A4	Q96G79	324 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909		Q96MF0	132 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	HBEGF	Q99075	208 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	HEY2	Q9UBP5	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	DKKL1	Q9UK85	242 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MSTN	O14793	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ARHGEF9	O43307	516 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZIC3	O60481	467 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TSPAN2	O60636	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SMPD2	O60906	423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RBP1	P09455	135 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	GRK2	P25098	689 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MAGEA12	P43365	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	GAS1	P54826	345 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CDH13	P55290	713 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF675	Q8TD23	568 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	KAT2A	Q92830	837 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PIP5K1A	Q99755	562 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	BRF2	Q9HAW0	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF225	Q9UK10	706 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909		H0YC42	278 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SMIM24	O75264	130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR4F21	O95013	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SBK3	P0C264	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CHN1	P15882	459 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CRYGS	P22914	178 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	DPP4	P27487	766 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	IL12B	P29460	328 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CD79B	P40259	229 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MC3R	P41968	323 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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