RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	GZMK	P49863	264 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	HNMT	P50135	292 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	CHIT1	Q13231	466 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	FGFBP1	Q14512	234 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	CRYM	Q14894	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	ARMC3	Q5W041	872 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	C4orf22	Q6V702	233 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	GGN	Q86UU5	652 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	C3orf56	Q8N813	242 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	SNX31	Q8N9S9	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	TMBIM1	Q969X1	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	DSN1	Q9H410	356 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NUP62-216	ENST00000599560	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560		A0A0A6YYD5	115 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GBA	P04062	536 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	COL6A2	P12110	1019 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MLN	P12872	115 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EPB42	P16452	691 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	IL11	P20809	199 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ADH6	P28332	368 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	BSG	P35613	385 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	DSCR9	P59020	149 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	DUSP2	Q05923	314 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GGTLC2	Q14390	218 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TGFBI	Q15582	683 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	LAS2	Q8IYD9	372 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR7G3	Q8NG95	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PHF11	Q9UIL8	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560		E7EQL1	145 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CBX7	O95931	251 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TGFA	P01135	160 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CTAGE8	P0CG41	777 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	HK1	P19367	917 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	HNF1A	P20823	631 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NT5E	P21589	574 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GGT5	P36269	586 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CDH11	P55287	796 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SPOCK1	Q08629	439 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	E2F2	Q14209	437 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MCU	Q8NE86	351 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PROX1	Q92786	737 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NPAS1	Q99742	590 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	MED11	Q9P086	117 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	NOTCH1	P46531	2555 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	TSPAN2	O60636	221 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	REM1	O75628	298 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	OPN1LW	P04000	364 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NUP62-216	ENST00000599560	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		10.75	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms