RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567817.5

CAPN3-217, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-217ENST00000567817 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 PCNX2A6NKB5 2137 aa5□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 CHD5Q8TDI0 1954 aa5□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 SDK1Q7Z5N4 2213 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 FAM227AF5H4B4 570 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 K7ERQ8 282 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPN3-217ENST00000567817 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 REEP1Q9H902 201 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPN3-217ENST00000567817 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.99□□□□□ -1.61
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