RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545678.1

RBM7-208, Transcript of RNA binding motif protein 7, human

TSL 3 BASIC

Gene RBM7, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM7-208	ENST00000545678	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	DOK1	Q99704	481 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ACTR8	Q9H981	624 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	FKRP	Q9H9S5	495 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	NOX4	Q9NPH5	578 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TAC3	Q9UHF0	121 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	HRK	O00198	91 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	NRDC	O43847	1150 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	F13A1	P00488	732 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	IGLV1-40	P01703	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	GSTM1	P09488	218 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	FCGR2A	P12318	317 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ACHE	P22303	614 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	OGDH	Q02218	1023 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	GSTM4	Q03013	218 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CHRNE	Q04844	493 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ICE2	Q659A1	982 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ADCK2	Q7Z695	626 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	AJUBA	Q96IF1	538 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CD244	Q9BZW8	370 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TMEM129	A0AVI4	362 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PPIAL4D	F5H284	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678		H7BY64	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	KRT3	P12035	628 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CHRM3	P20309	590 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	EDNRA	P25101	427 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	MSH2	P43246	934 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TMEM33	P57088	247 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	SLAMF1	Q13291	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	HERC3	Q15034	1050 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678		Q6ZS46	218 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	RAB39B	Q96DA2	213 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TRABD	Q9H4I3	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CA10	Q9NS85	328 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	PKP3	Q9Y446	797 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ARL5A	Q9Y689	179 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	SYCE3	A1L190	88 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	C17orf105	B2RV13	164 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	CBR3	O75828	277 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TGFB1	P01137	390 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	IFNA16	P05015	189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TUBB	P07437	444 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ERG	P11308	486 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	TNNT1	P13805	278 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF12	P17014	697 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	GGT1	P19440	569 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	IGHV1-2	P23083	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	SRD5A2	P31213	254 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	DGCR2	P98153	550 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	MVK	Q03426	396 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM7-208	ENST00000545678	ZBTB17	Q13105	803 aa		7.36	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms