RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 FCRLAQ7L513 359 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ADCK2Q7Z695 626 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 IQCHQ86VS3 1027 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 LRRC34Q8IZ02 419 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ANKFN1Q8N957 763 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 OR5T1Q8NG75 326 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 OR52J3Q8NH60 311 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 AKR7LQ8NHP1 331 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 MITD1Q8WV92 249 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ASZ1Q8WWH4 475 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 MR1Q95460 341 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 FBXO32Q969P5 355 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 SLAMF9Q96A28 289 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 MS4A10Q96PG2 267 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PANK2Q9BZ23 570 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 OCR1Q9BZK8 76 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 RAB33BQ9H082 229 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 FAM107BQ9H098 131 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ASB8Q9H765 288 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PALMDQ9NP74 551 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TREM1Q9NP99 234 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TRPC4Q9UBN4 977 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 CYTH4Q9UIA0 394 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 VANGL2Q9ULK5 521 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 NACADO15069 1562 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa3□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PRDM2Q13029 1718 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 UQCRHLA0A096LP55 91 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 URADA6NGE7 173 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 IQCF5A8MTL0 148 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PSMD11O00231 422 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PDHXO00330 501 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PRRG1O14668 218 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 LRRTM2O43300 516 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 MED7O43513 233 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 SSX5O60225 188 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 SURF6O75683 361 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 RBBP9O75884 186 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 CDK14O94921 469 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 AHSA1O95433 338 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 LGI1O95970 557 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 MBD3O95983 291 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 BCL10O95999 233 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 AK1P00568 194 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 IFNA14P01570 189 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 HMGN1P05114 100 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 CAPN1P07384 714 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 UQCRHP07919 91 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 YES1P07947 543 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 DANCRP0C864 163 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ODC1P11926 461 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 GP1BBP13224 206 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PFKFB1P16118 471 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 CALB2P22676 271 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 NDST2P52849 883 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 CAPZA1P52907 286 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 NAGLUP54802 743 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 SCRN3Q0VDG4 424 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ALX1Q15699 326 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 HYAL4Q2M3T9 481 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 KLHL40Q2TBA0 621 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 HFEQ30201 348 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 GPR33Q49SQ1 333 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 C10orf120Q5SQS8 335 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 WSCD1Q658N2 575 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 CLEC6AQ6EIG7 209 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM270Q6UE05 265 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ASPGQ86U10 573 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 BIVMQ86UB2 503 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 ELMOD2Q8IZ81 293 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRK-220ENST00000531466 LIX1Q8N485 282 aa2.99□□□□□ -1.93
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