RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 JADE3Q92613 823 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 OR7D2Q96RA2 312 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ECSITQ9BQ95 431 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ING2Q9H160 280 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 OR51I1Q9H343 314 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 MYOTQ9UBF9 498 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 L3MBTL1Q9Y468 752 aa20.38■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 MED13Q9UHV7 2174 aa20.37■□□□□ 0.85
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PACSIN3-205ENST00000528462 GZMMP51124 257 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CORO7P57737 925 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 NPSR1Q6W5P4 371 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 C10orf111Q8N326 155 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC5A8Q8N695 610 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 OR5D16Q8NGK9 328 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC35A4Q96G79 324 aa20.37■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.37■□□□□ 0.85
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PACSIN3-205ENST00000528462 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PACSIN3-205ENST00000528462 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PACSIN3-205ENST00000528462 ADRM1Q16186 407 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 OR10A6Q8NH74 314 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF583Q96ND8 569 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CDRT15Q96T59 188 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 EXD2Q9NVH0 621 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 LIPT1Q9Y234 373 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ARGFXA6NJG6 315 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 AK1P00568 194 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 GABRA3P34903 492 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CASP9P55211 416 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TMPRSS3P57727 454 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXK2Q01167 660 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 RBBP4Q09028 425 aa20.35■□□□□ 0.85
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PACSIN3-205ENST00000528462 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.35■□□□□ 0.85
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PACSIN3-205ENST00000528462 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC15A4Q8N697 577 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR151Q8TDV0 419 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 BTBD2Q9BX70 525 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 A4GALTQ9NPC4 353 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 GUSBP08236 651 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGAP37287 484 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGGQ5H8A4 983 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 GALNT16Q8N428 558 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 COX18Q8N8Q8 333 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO30Q8TB52 745 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB8BQ92930 207 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ALG2Q9H553 416 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ADA2Q9NZK5 511 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CD300AQ9UGN4 299 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 A8MVJ9 347 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CDK2AP1O14519 115 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TFPTP0C1Z6 253 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 HSD17B1P14061 328 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 ITPKBP27987 946 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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PACSIN3-205ENST00000528462 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 PTOV1Q86YD1 416 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TAGAPQ8N103 731 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM110BQ8TC76 370 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CDS1Q92903 461 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 TEKT2Q9UIF3 430 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-205ENST00000528462 CBLCQ9ULV8 474 aa20.34■□□□□ 0.85
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