RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517048.1

RNU6-389P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 389, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-389P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-389P-201ENST00000517048 A0A1W2PPE2 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 A0A1W2PR64 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GHRP10912 638 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 RAB28P51157 221 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SLC39A6Q13433 755 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ALCAMQ13740 583 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 CAMK4Q16566 473 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 CDKN3Q16667 212 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 UBE2SQ16763 222 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ITIH5Q86UX2 942 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 LUZP1Q86V48 1076 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 C12orf56Q8IXR9 622 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 TRPV3Q8NET8 790 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 MCHR2Q969V1 340 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 HAVCR1Q96D42 359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 TVP23CQ96ET8 276 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 VPS39Q96JC1 886 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 NPAS2Q99743 824 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 TXN2Q99757 166 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GPR61Q9BZJ8 451 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 CXXC4Q9H2H0 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 HAUS2Q9NVX0 235 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GDAP2Q9NXN4 497 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 TMED7Q9Y3B3 224 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 OR1A2Q9Y585 309 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SEC16AO15027 2179 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PFASO15067 1338 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 FGD5Q6ZNL6 1462 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 MUC5ACP98088 5654 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 A0A1B0GW55 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ANKDD1BA6NHY2 528 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 M0R296 226 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 EFNA2O43921 213 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PDE5AO76074 875 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 OAS1P00973 400 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DUX4L2P0CJ85 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DUX4L3P0CJ86 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DUX4L5P0CJ88 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DUX4L6P0CJ89 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DUX4L7P0CJ90 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 TCF4P15884 667 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GJB2P29033 226 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 MTTPP55157 894 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ZNF85Q03923 595 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 UGCGQ16739 394 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 WDR49Q8IV35 697 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GIMAP1Q8WWP7 306 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 TMEM158Q8WZ71 300 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 RAD54LQ92698 747 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PDXPQ96GD0 296 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 OR10C1Q96KK4 312 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ABHD1Q96SE0 405 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 STACQ99469 402 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GDF3Q9NR23 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PIGVQ9NUD9 493 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 DUX4Q9UBX2 424 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ADGRL1O94910 1474 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 A6NCN8 305 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 NPIPA5E9PKD4 350 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 C11orf98E9PRG8 122 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GSTA2P09210 222 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SAA4P35542 130 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 OR3A1P47881 315 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 NSDHLQ15738 373 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PIGGQ5H8A4 983 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PAGE3Q5JUK9 113 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 Q6ZR03 302 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 GPR142Q7Z601 462 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 RMDN2Q96LZ7 410 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 TIGD1Q96MW7 591 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 ZNF558Q96NG5 402 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 IFI27L2Q9H2X8 130 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 SLC25A19Q9HC21 320 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 PDE7BQ9NP56 450 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-389P-201ENST00000517048 RAB9BQ9NP90 201 aa0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms