RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 HEATR9A2RTY3 570 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MSGN1A6NI15 193 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SNTNA6NMZ2 147 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CYB561D2O14569 222 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CASKO14936 926 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CTAG2O75638 210 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R3DO95685 299 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 IGSF6O95976 241 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CLPTM1O96005 669 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TBXA2RP21731 343 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEA8P43361 318 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DSCR9P59020 149 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 IL9RQ01113 521 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 BNIP1Q12981 228 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 GCKRQ14397 625 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DOK6Q6PKX4 331 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 LACC1Q8IV20 430 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL14Q8N4G2 192 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC15Q8TF66 581 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 STARD8Q92502 1023 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 LHX4Q969G2 390 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DUX5Q96PT3 197 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NMUR1Q9HB89 426 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 THEGQ9P2T0 379 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 KLK11Q9UBX7 282 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TCF19Q9Y242 345 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0A6YYD4 124 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM74A7A6NL05 159 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 WRBO00258 174 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN12O95859 305 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 FSHBP01225 129 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ALPIP09923 528 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ADORA3P0DMS8 318 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PAX1P15863 534 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ART1P52961 327 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ATL3Q6DD88 541 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC80Q76M96 950 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CHMP1BQ7LBR1 199 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 BIVMQ86UB2 503 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PAQR7Q86WK9 346 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 STPG4Q8N801 248 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52K1Q8NGK4 314 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ART4Q93070 314 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PELI1Q96FA3 418 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf34Q96L11 122 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP4Q96P64 663 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CITED1Q99966 193 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 CLSTN2Q9H4D0 955 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 Q9HAA7 133 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 FANCEQ9HB96 536 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP14Q9HCL3 533 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ANAPC7Q9UJX3 599 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAM28Q9UKQ2 775 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF521Q96K83 1311 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PR80 420 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 BTBD17A6NE02 478 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NBR2O15453 112 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 STX11O75558 287 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GAT3O94766 335 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 OAZ2O95190 189 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 NADKO95544 446 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-209ENST00000473406 IGF1P05019 195 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms