RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445304.1

RPL17P1-201, Transcript of ribosomal protein L17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RPL17P1, Length 536 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P1-201ENST00000445304 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.55□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.55□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 FIS1Q9Y3D6 152 aa8.55□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TACC2O95359 2948 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TMEM233B4DJY2 109 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PIP5K1BO14986 540 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 SNPHO15079 494 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PDPK1O15530 556 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TSPAN2O60636 221 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TBX19O60806 448 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ICOSLGO75144 302 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PSMG1O95456 288 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 BPGMP07738 259 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 COX6B1P14854 86 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 CREB1P16220 341 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 SDC1P18827 310 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TACR1P25103 407 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PTPN6P29350 595 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 IL12BP29460 328 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 KRT20P35900 424 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PTGDSP41222 190 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 MC3RP41968 323 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ETV4P43268 484 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ASMTP46597 345 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TRPC1P48995 793 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 CORO7P57737 925 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 NUP107P57740 925 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PMPCAQ10713 525 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 EFR3AQ14156 821 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 XKR7Q5GH72 579 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TMEM107Q6UX40 140 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 DDIASQ8IXT1 998 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 OR2L13Q8N349 312 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ELP4Q96EB1 424 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 GNRHR2Q96P88 292 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 NODALQ96S42 347 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 REEP4Q9H6H4 257 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 RNF6Q9Y252 685 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.54□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 FBN2P35556 2912 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 FREM3P0C091 2139 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TTC36A6NLP5 189 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 AHRRA9YTQ3 701 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TMEM114B3SHH9 223 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 UPK1AO00322 258 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 GNB5O14775 395 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TM9SF1O15321 606 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 REM1O75628 298 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 CBR3O75828 277 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TRAPPC6AO75865 159 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 GLI4P10075 376 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 BCKDHAP12694 445 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 MAPK1P28482 360 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PNLIPRP2P54317 469 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PSG6Q00889 435 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 PDE7AQ13946 482 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 TOMM20Q15388 145 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 GALNTL6Q49A17 601 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 DESI1Q6ICB0 168 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 RTL6Q6ICC9 239 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 CROCCP2Q86T23 111 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RPL17P1-201ENST00000445304 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms