RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF3P17036 446 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ME2P23368 584 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJB1P25685 340 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 EPHX2P34913 555 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 KRT20P35900 424 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GGT5P36269 586 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SPAM1P38567 509 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CAPGP40121 348 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MTHFRP42898 656 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G16P53816 162 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RAD23AP54725 363 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 AQP5P55064 265 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TAS2R38P59533 333 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 DCDC1P59894 354 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ACTR2P61160 394 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ASIC1P78348 528 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GSTO1P78417 241 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF45Q02386 682 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MERTKQ12866 999 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 EFR3AQ14156 821 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FLOT2Q14254 428 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 HKDC1Q2TB90 917 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PNCKQ6P2M8 343 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 EPGNQ6UW88 154 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CYS1Q717R9 158 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GPR142Q7Z601 462 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GALNT10Q86SR1 603 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ASPGQ86U10 573 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ERO1BQ86YB8 467 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CRLF3Q8IUI8 442 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 BLIDQ8IZY5 108 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 METTL4Q8N3J2 472 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SFRP1Q8N474 314 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RAD54LQ92698 747 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GTF2H4Q92759 462 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GPR137Q96N19 417 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 BBS4Q96RK4 519 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CHID1Q9BWS9 393 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 IDI2Q9BXS1 227 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 LAT2Q9GZY6 243 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 THAP2Q9H0W7 228 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 DSN1Q9H410 356 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GINS2Q9Y248 185 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
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