RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 OR4N5Q8IXE1 308 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CHST14Q8NCH0 376 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 FUOMA2VDF0 154 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DRGXA6NNA5 263 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PRKXP51817 358 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 VWA5B2Q8N398 1253 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA2P01563 188 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CCINQ13939 588 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DTX3Q8N9I9 347 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB1C1Q8TD33 95 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf34Q96L11 122 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GJD2Q9UKL4 321 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GPR52Q9Y2T5 361 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF1BP20333 461 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OPRL1P41146 370 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RIN1Q13671 783 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RUNX3Q13761 415 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC58Q4VC31 144 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MR1Q95460 341 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GPR34Q9UPC5 381 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB2O95178 105 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CSF2RAP15509 400 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MEGF11A6BM72 1044 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TGM7Q96PF1 710 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR2S2Q9NQN1 319 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LYRM1O43325 122 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 JUNDP17535 347 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NPR2P20594 1047 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DDCP20711 480 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NTSR1P30989 418 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GGT2P36268 569 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NKX3-2P78367 333 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 BORAQ6PGQ7 559 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LCTLQ6UWM7 567 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CDRT4Q8N9R6 151 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 KLF15Q9UIH9 416 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 OR1A2Q9Y585 309 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GRPRP30550 384 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CXCR4P61073 352 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SHC2P98077 582 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZXDBP98169 803 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 GRM7Q14831 915 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LEG1Q6P5S2 330 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LAS2Q8IYD9 372 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 SPARTQ8N0X7 666 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ADH6P28332 368 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf61Q13536 156 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF767PQ75MW2 155 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB119Q8N690 84 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 PINK1Q9BXM7 581 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TGM5O43548 720 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 UPK1BO75841 260 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 MAS1P04201 325 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 CA5AP35218 305 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ARL6IP1Q15041 203 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 IL1RNP18510 177 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TCTE1Q5JU00 501 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-201ENST00000284617 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms