RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261349.8

LRP6-201, Transcript of LDL receptor related protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP6, Length 10,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6-201ENST00000261349 H3BSH0 61 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PTAFRP25105 342 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 RAB40BQ12829 278 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 FRG2Q64ET8 278 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 VASNQ6EMK4 673 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 STEAP2Q8NFT2 490 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 MARVELD3Q96A59 401 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SGK3Q96BR1 496 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 FBXO17Q96EF6 278 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 CHFRQ96EP1 664 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 FRG2BQ96QU4 278 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 KATNB1Q9BVA0 655 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SYT4Q9H2B2 425 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PIM2Q9P1W9 311 aa4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 LRRC72A6NJI9 287 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 C22orf31O95567 290 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 OSMP13725 252 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 GTF2F2P13984 249 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 GNSP15586 552 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 RHOQP17081 205 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 CPT2P23786 658 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 GKP32189 559 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 KHKP50053 298 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 KLRG1Q96E93 195 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SLC19A3Q9BZV2 496 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 FLVCR2Q9UPI3 526 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 GBAP04062 536 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ACADMP11310 421 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.675e-7■■■■□ 19.9
LRP6-201ENST00000261349 MTNR1AP48039 350 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SKP1P63208 163 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SFXN4Q6P4A7 337 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 FAHD1Q6P587 224 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.59□□□□□ -1.67
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LRP6-201ENST00000261349 TEPSINQ96N21 525 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ATF6BQ99941 703 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ACPTQ9BZG2 426 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 LDAHQ9H6V9 325 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 HHATLQ9HCP6 504 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 A0A0U1RQS6 177 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PLSCR1O15162 318 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PTP4A3O75365 173 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 NQO2P16083 231 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 HCCSP53701 268 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 BACE1P56817 501 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ADAM8P78325 824 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 SCAPQ12770 1279 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 BIKQ13323 160 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 NDUFA9Q16795 377 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ODF4Q2M2E3 257 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ZNF311Q5JNZ3 666 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ZNF529Q6P280 563 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 CLDN19Q8N6F1 224 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 ZNF565Q8N9K5 539 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 OR4K5Q8NGD3 323 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 DOCK2Q92608 1830 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 TRAPPC13A5PLN9 417 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 TRABD2BA6NFA1 517 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 H3BRB1 525 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 RNF13O43567 381 aa4.59□□□□□ -1.67
LRP6-201ENST00000261349 LY86O95711 162 aa4.59□□□□□ -1.67
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