RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548		M0QYG6	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	TLR4	O00206	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	LGALS8	O00214	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	HS3ST1	O14792	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	B4GALT2	O60909	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CDH16	O75309	829 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CLN5	O75503	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	LCAT	P04180	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	C2	P06681	752 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTR1B	P42025	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SERPINB8	P50452	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SUOX	P51687	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CLCN7	P51798	805 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	C21orf59	P57076	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	DCDC1	P59894	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	PFN3	P60673	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NFATC4	Q14934	902 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	GPR22	Q99680	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	ALG9	Q9H6U8	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548		A0A1W2PR77	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548		B4DGG1	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CYR61	O00622	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	IDH3B	O43837	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	PEX1	O43933	1283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NUAK1	O60285	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	MPIG6B	O95866	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	LGI1	O95970	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	OPN1LW	P04000	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	GLA	P06280	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CHRM2	P08172	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	GSTA2	P09210	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	TSPAN8	P19075	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	BDKRB1	P46663	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	RAB10	P61026	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	GALK2	Q01415	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARID1B-226	ENST00000637548	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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