RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623047.1

CU638689.4-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CU638689.4, Length 5,990 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU638689.4-201ENST00000623047 Q6ZNB5 142 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 CADM2Q8N3J6 435 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 FBXL8Q96CD0 374 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TLCD1Q96CP7 247 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 OR51F1A6NGY5 319 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 LRATO95237 230 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ARR3P36575 388 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 HLCSP50747 726 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 KLC1Q07866 573 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 E2F2Q14209 437 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 GUSBP11Q6P575 273 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PLD3Q8IV08 490 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 FBXW5Q969U6 566 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PANX1Q96RD7 426 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 RFXANKO14593 260 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PLIN3O60664 434 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PRF1P14222 555 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 HSD11B1P28845 292 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 GRIA1P42261 906 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ARL6IP1Q15041 203 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF382Q96SR6 550 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TSC22D3Q99576 134 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 MAFKO60675 156 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 EBLN1P0CF75 366 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TUBG1P23258 451 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 RPS6KA3P51812 740 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 EPS8Q12929 822 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PYCR3Q53H96 274 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 FGD3Q5JSP0 725 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 USP51Q70EK9 711 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 MMP21Q8N119 569 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 IL21Q9HBE4 155 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.17□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 STX16O14662 325 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SPICQ8N5J4 248 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 CCL19Q99731 98 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 NPAS2Q99743 824 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ADAM12O43184 909 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PCDH7O60245 1069 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 CBR3O75828 277 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 BCKDHBP21953 392 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 DNASE1L1P49184 302 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 RGS6P49758 472 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 PPP3R1P63098 170 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 HERVK_113P63132 956 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 IKZF1Q13422 519 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ADCK1Q86TW2 530 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF786Q8N393 782 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 SORCS1Q8WY21 1168 aa7.16□□□□□ -1.26
CU638689.4-201ENST00000623047 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms