RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 SAXO2Q658L1 398 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMARCD3Q6STE5 483 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 CAMKMTQ7Z624 323 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC00346Q8IVM7 164 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXO25Q8TCJ0 367 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TEKT4Q8WW24 435 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 FGGYQ96C11 551 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 HAVCR1Q96D42 359 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 PCED1BQ96HM7 432 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCLT1Q96NL6 688 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 NPAS2Q99743 824 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 COQ7Q99807 217 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TEX12Q9BXU0 123 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 IFI27L2Q9H2X8 130 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 NANSQ9NR45 359 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 LUZP4Q9P127 313 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMC3Q9UQE7 1217 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A0A6YYD4 124 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A1W2PNN7 141 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 C7orf66A4D0T2 115 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 PI4KAP2A4QPH2 592 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 B4E171 279 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 RRP8O43159 456 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 EFNA2O43921 213 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 GBAP04062 536 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSF2P04141 144 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 PCCBP05166 539 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 STSP08842 583 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 WARSP23381 471 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 GCH1P30793 250 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSPA4P34932 840 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSPAN7P41732 249 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAGEB1P43366 347 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 GPC3P51654 580 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 VCPP55072 806 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 MTTPP55157 894 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 RHBDL3P58872 404 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABRQ12979 859 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT32Q14532 448 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 NTRK2Q16620 822 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 DCAF12Q5T6F0 453 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ENPP7Q6UWV6 458 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACP7Q6ZNF0 438 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 COX15Q7KZN9 410 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM110Q86TL2 294 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ITIH5Q86UX2 942 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf64Q86WR6 236 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ERICH1Q86X53 443 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 WDR49Q8IV35 697 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBALD2Q8IYN6 164 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TC2NQ8N9U0 490 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR6J1Q8NGC5 347 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 NCOA7Q8NI08 942 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 RFESDQ8TAC1 157 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 GOLGA5Q8TBA6 731 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEPT8Q92599 483 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPSB1Q96BD6 273 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 C5orf30Q96GV9 206 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRAM1Q96QH2 718 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2M2Q96R28 347 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 CARD6Q9BX69 1037 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TM2D1Q9BX74 207 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 FN3KQ9H479 309 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 NARFLQ9H6Q4 476 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 MINDY3Q9H8M7 445 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH2D2AQ9NP31 389 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 AASSQ9UDR5 926 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 EMCNQ9ULC0 261 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB23Q9ULC3 237 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATG4BQ9Y4P1 393 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ETV7Q9Y603 341 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A087X0M5 115 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A0B4J203 849 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A1B0GX30 115 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TUBAL3A6NHL2 446 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSPY2A6NKD2 308 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC188H7C350 402 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 LAD1O00515 517 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPIP5K2O43314 1243 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM189A1O60320 539 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSPAN2O60636 221 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANXA9O76027 345 aa-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms