RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559834.1

HDDC3-204, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene HDDC3, Length 1,076 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-204ENST00000559834 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.34□□□□□ -1.07
HDDC3-204ENST00000559834 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.34□□□□□ -1.07
HDDC3-204ENST00000559834 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HDDC3-204ENST00000559834 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 FRG2CA6NGY1 282 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 STX16O14662 325 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 MSTNO14793 375 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 TO15178 435 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SMPD2O60906 423 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SMIM24O75264 130 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 UGT2B11O75310 529 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 FPR1P21462 350 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SRD5A2P31213 254 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PHBP35232 272 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PTGDSP41222 190 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 STARP49675 285 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SERPINB8P50452 374 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GFRA1P56159 465 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PSPHP78330 225 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 HMGCS1Q01581 520 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GUCY2DQ02846 1103 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 MGAT2Q10469 447 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 EFR3AQ14156 821 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 POU4F3Q15319 338 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 NNATQ16517 81 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 BCL2A1Q16548 175 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SGO1Q5FBB7 561 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 OR2A2Q6IF42 318 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 ERP27Q96DN0 273 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SFXN2Q96NB2 322 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PIP5K1AQ99755 562 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 BDH2Q9BUT1 245 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 BRF2Q9HAW0 419 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SNX6Q9UNH7 406 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PLLPQ9Y342 182 aa8.33□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 ZFHX3Q15911 3703 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 HMX2A2RU54 273 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PLOD2O00469 737 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 ESRRBO95718 433 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 CBX7O95931 251 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 OTCP00480 354 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 COL6A2P12110 1019 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PEPDP12955 493 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 CNTFP26441 200 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SOX18P35713 384 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 ALDH9A1P49189 494 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 EMDP50402 254 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 LHX2P50458 406 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 DESI1Q6ICB0 168 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SELENOMQ8WWX9 145 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 TMBIM1Q969X1 311 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 KLHL29Q96CT2 875 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SLC35A4Q96G79 324 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 ADOQ96SZ5 270 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SMR3AQ99954 134 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 DKKL1Q9UK85 242 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 PCTPQ9UKL6 214 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 NFU1Q9UMS0 254 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 DOCK7Q96N67 2140 aa8.32□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 AKAP9Q99996 3911 aa8.31□□□□□ -1.08
HDDC3-204ENST00000559834 A0A1B0GTL3 188 aa8.31□□□□□ -1.08
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