RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558836.5

CUX1-217, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 2,965 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-217ENST00000558836 KDM1AO60341 852 aa9.96□□□□□ -0.81
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CUX1-217ENST00000558836 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CUX1-217ENST00000558836 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CUX1-217ENST00000558836 SOX18P35713 384 aa9.95□□□□□ -0.82
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