RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 LRRC39Q96DD0 335 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 HEY2Q9UBP5 337 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 E7ESA3 106 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TXNDC9O14530 226 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SERPINI2O75830 405 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZFAND5O76080 213 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ETS2P15036 469 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PCSK2P16519 638 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 HSD17B2P37059 387 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MC3RP41968 323 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 HK2P52789 917 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 REEP5Q00765 189 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GXYLT1Q4G148 440 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 STEAP4Q687X5 459 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 LIX1Q8N485 282 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FAM110BQ8TC76 370 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TMBIM1Q969X1 311 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MS4A8Q9BY19 250 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ITPAQ9BY32 194 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MED11Q9P086 117 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PLLPQ9Y342 182 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PR80 420 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SYCE1LA8MT33 242 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 MYL2P10916 166 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ATP6V0D1P61421 351 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TRIB1Q96RU8 372 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CYR61O00622 381 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SNPHO15079 494 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PCDH7O60245 1069 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CDH16O75309 829 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SBK3P0C264 359 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 KIR3DL1P43629 444 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SLC6A12P48065 614 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 UNC50Q53HI1 259 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GPR151Q8TDV0 419 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NSL1Q96IY1 281 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RILPQ96NA2 401 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 NPAS1Q99742 590 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 LDLRP01130 860 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 C1QAP02745 245 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 GCAP28676 217 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 HNMTP50135 292 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 PWP1Q13610 501 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 KRT72Q14CN4 511 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 RAET1LQ5VY80 246 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-212ENST00000548567 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms