RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q6ZRG5 221 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM26Q6ZUK4 368 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ITIH5Q86UX2 942 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR49Q8IV35 697 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAGAPQ8N103 731 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMYD1Q8NB12 490 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC197Q8NCU1 140 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PELI1Q96FA3 418 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEP170P1Q96L14 293 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FEM1AQ9BSK4 669 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TM2D1Q9BX74 207 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF350Q9GZX5 532 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NARFLQ9H6Q4 476 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB9BQ9NP90 201 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ESM1Q9NQ30 184 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NANSQ9NR45 359 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMED7Q9Y3B3 224 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FGD5Q6ZNL6 1462 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SVILO95425 2214 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A8MUA0 341 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEI4A8MW99 385 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MSH4O15457 936 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DOK2O60496 412 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPAN2O60636 221 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TADA2AO75478 443 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OAS1P00973 400 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV3-48P01763 117 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STSP08842 583 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UQCRC2P22695 453 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR3A1P47881 315 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF85Q03923 595 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CMPK2Q5EBM0 449 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM219AQ8IW50 185 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR174Q9BXC1 333 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLEK2Q9NYT0 353 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1A2Q9Y585 309 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PFASO15067 1338 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KAT6BQ8WYB5 2073 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSAPA4D1B5 854 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GJE1A6NN92 205 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C11orf94C9JXX5 98 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 J3KRW8 73 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTDNEP1O95476 244 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1D2P34982 312 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HOXD13P35453 343 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BTDP43251 543 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB28P51157 221 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 METAP1P53582 386 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VCPP55072 806 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOP14P78316 857 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL18R1Q13478 541 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LGSNQ5TDP6 509 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC30Q5VVM6 783 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5M10Q6IEU7 315 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q6ZR03 302 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q8NDZ9 215 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAD54LQ92698 747 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF558Q96NG5 402 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLHL4Q9C0H6 718 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRBC2A0A5B9 178 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DHRS7CA6NNS2 312 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZCCHC18P0CG32 403 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HOXA9P31269 272 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NF2P35240 595 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APOC4P55056 127 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PUDPQ08623 228 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGCGQ16739 394 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC36Q1X8D7 754 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPV3Q8NET8 790 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAVCR1Q96D42 359 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A19Q9HC21 320 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAUS2Q9NVX0 235 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SOHLH2Q9NX45 425 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF391Q9UJN7 358 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHGR1C9JFL3 82 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 M0R296 226 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPIP5K2O43314 1243 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms