RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		10.21	□□□□□ -0.77
GTPBP1-208	ENST00000475959	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959		B4DXG7	233 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLOD3	O60568	738 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPM1B	O75688	479 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNJ2	P63252	427 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSG6	Q00889	435 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDSN	Q15517	529 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	HHAT	Q5VTY9	493 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL23R	Q5VWK5	629 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD163	Q86VB7	1156 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2L13	Q8N349	312 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIO2	Q92813	273 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMBIM1	Q969X1	311 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	RELT	Q969Z4	430 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTNG2	Q96CW9	530 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC120	Q96HB5	630 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	RILP	Q96NA2	401 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED12	Q93074	2177 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACOT7	O00154	380 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAM10	O14672	748 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	T	O15178	435 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBX19	O60806	448 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	G6PD	P11413	515 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABO	P16442	354 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPIC	P45877	212 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIO3	P55073	304 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRG3	P56975	720 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	STX3	Q13277	289 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	EMC4	Q5J8M3	183 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC34A3	Q8N130	599 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	GIMAP5	Q96F15	307 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF597	Q96LX8	424 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF12	Q96QT6	1004 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	DOHH	Q9BU89	302 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUF2	Q9BZD4	464 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	EQTN	Q9NQ60	294 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRODH2	Q9UF12	536 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.19	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WV62	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLOD2	O00469	737 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCL21	O00585	134 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SDHD	O14521	159 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNB5	O14775	395 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPAN2	O60636	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	COQ9	O75208	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	SASH3	O75995	380 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHG3	P01860	377 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAMP1	P11279	417 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	DRD5	P21918	477 aa		10.18	□□□□□ -0.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRK2	P25098	689 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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