RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410735.1

RNU6-394P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 394, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-394P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUX4L2P0CJ85 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUX4L3P0CJ86 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUX4L5P0CJ88 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUX4L6P0CJ89 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUX4L7P0CJ90 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 KRT3P12035 628 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 EZRP15311 586 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 GLRA1P23415 457 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 MC1RQ01726 317 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 PUDPQ08623 228 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 CETN1Q12798 172 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUSP28Q4G0W2 176 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 LRRC73Q5JTD7 316 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 NANOGP8Q6NSW7 305 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 CHST3Q7LGC8 479 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 SZRD1Q7Z422 152 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 WDR49Q8IV35 697 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 CCDC197Q8NCU1 140 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 TRPV3Q8NET8 790 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 FGGYQ96C11 551 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 HAVCR1Q96D42 359 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 TVP23CQ96ET8 276 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 LRRC3BQ96PB8 259 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 FEM1AQ9BSK4 669 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 SLC25A19Q9HC21 320 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 GDAP2Q9NXN4 497 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 PLEK2Q9NYT0 353 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUX4Q9UBX2 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 DUSP12Q9UNI6 340 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 ITM2BQ9Y287 266 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 IFT52Q9Y366 437 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 TMED7Q9Y3B3 224 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 OR1A2Q9Y585 309 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-394P-201ENST00000410735 YEATS2Q9ULM3 1422 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 PGPEP1LA6NFU8 196 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 DHRS7CA6NNS2 312 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 AGAP14A8MT82 685 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 B4E171 279 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 TADA2AO75478 443 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 CISD3P0C7P0 127 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 TCF4P15884 667 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 DLSTP36957 453 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 TSPAN7P41732 249 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 PSMD6Q15008 389 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 LUZP1Q86V48 1076 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 FAM219AQ8IW50 185 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ZNF740Q8NDX6 193 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 NCOA7Q8NI08 942 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 OR10C1Q96KK4 312 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ZNF558Q96NG5 402 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 C19orf43Q9BQ61 176 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 TM2D1Q9BX74 207 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 SYNCQ9H7C4 482 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 MINDY3Q9H8M7 445 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 TRPC4Q9UBN4 977 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 CLN5O75503 358 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 GBAP04062 536 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 NF2P35240 595 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 METAP1P53582 386 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 VCPP55072 806 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 Q6ZRG5 221 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 DNAAF5Q86Y56 855 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 GIMAP1Q8WWP7 306 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 LRRC58Q96CX6 371 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 GCNAQ96QF7 691 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 OR2M2Q96R28 347 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ABHD1Q96SE0 405 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 IFI27L2Q9H2X8 130 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 UNC45AQ9H3U1 944 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 CENPMQ9NSP4 180 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 EMCNQ9ULC0 261 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 A0A087X0M5 115 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 A0A1B0GX30 115 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 YJEFN3A6XGL0 299 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 LAD1O00515 517 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 FLRT2O43155 660 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ZNF264O43296 627 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 PEX14O75381 377 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ANP32DO95626 131 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 CSF2P04141 144 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-394P-201ENST00000410735 SPP1P10451 314 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms