RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 OR56B4Q8NH76 319 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 FANK1Q8TC84 345 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 YIPF5Q969M3 257 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 GULP1Q9UBP9 304 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 FBXW2Q9UKT8 454 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 NINQ8N4C6 2090 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 B3GALNT1O75752 331 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 GPR33Q49SQ1 333 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 OR5T2Q8NGG2 359 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.53■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 OTOFQ9HC10 1997 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 POM121CA8CG34 1229 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 H3BNC9 293 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 ACSL4O60488 711 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 F2P00734 622 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 ALDOBP05062 364 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 CALCRP30988 508 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 MTNR1BP49286 362 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 CCL23P55773 120 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 ACSM1Q08AH1 577 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 SCRN3Q0VDG4 424 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 CD300LDQ6UXZ3 194 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 ELMOD3Q96FG2 381 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 ACTR6Q9GZN1 396 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 EMC3Q9P0I2 261 aa20.52■□□□□ 0.88
OPN3-201ENST00000366554 SH3BGRLO75368 114 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 HIST1H2ADP20671 130 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 GALP22466 123 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 PFN3P60673 137 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 GPR17Q13304 367 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 DOC2AQ14183 400 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 IGSF11Q5DX21 431 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 COQ8AQ8NI60 647 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.52■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 UGDHO60701 494 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 EFCAB14O75071 495 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 CD3GP09693 182 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 CCR7P32248 378 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 RPL35P42766 123 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ZNF649Q9BS31 505 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 RING1Q06587 406 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ASB11Q8WXH4 323 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 BEX1Q9HBH7 125 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 GPR160Q9UJ42 338 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 PLXNA3P51805 1871 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 MPTX1A8MV57 137 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 PRSS44E7EML9 344 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 L7N2F9 121 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 CBX7O95931 251 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 REEP3Q6NUK4 255 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SCARB1Q8WTV0 552 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 REEP4Q9H6H4 257 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 ACAD8Q9UKU7 415 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 F8W036 122 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 APOC3P02656 99 aa20.5■□□□□ 0.87
OPN3-201ENST00000366554 C8GP07360 202 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms