RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP10O43572 662 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6AP2O75787 350 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLITRK5O94991 958 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZWINTO95229 277 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA4LO95757 839 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFPL3SP0C7P2 107 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYZAPP0CAP1 466 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A8P0DMV1 189 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A9P0DMV2 189 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCKDHAP12694 445 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CORO7P57737 925 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADORA2A-AS1P86434 159 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE7AQ13946 482 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF385BQ569K4 471 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A2Q5DJT8 189 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 DESI1Q6ICB0 168 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTFR2Q6P444 385 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM107Q6UX40 140 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPSR1Q6W5P4 371 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD163Q86VB7 1156 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC34A3Q8N130 599 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NTNG2Q96CW9 530 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF597Q96LX8 424 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP3R2Q96LZ3 170 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 RILPQ96NA2 401 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL4Q9BY76 406 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 REEP4Q9H6H4 257 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK9Q9NPC2 374 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAST4O15021 2626 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087WV62 115 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM10O14672 748 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDPK1O15530 556 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBX19O60806 448 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERN1O75460 977 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMG1O95456 288 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPOP07202 933 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASP3P42574 277 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPP38P78345 283 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAOXQ6QHF9 649 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3P1Q6ZMU1 363 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRILQ7L0X0 811 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF781Q8N8C0 355 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPCDCQ96CD2 204 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NODALQ96S42 347 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 FREM3P0C091 2139 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAV2Q8IVL1 2488 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GVC2 190 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLOD2O00469 737 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX11AO75192 247 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 COQ9O75208 318 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT2B11O75310 529 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 BGNP21810 368 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASMTP46597 345 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf136Q5SQH8 315 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM81Q6P7N7 255 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPTNQ6XPR3 784 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2L13Q8N349 312 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMBIM1Q969X1 311 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMRTA2Q96SC8 542 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SORT1Q99523 831 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf50Q9BV19 199 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf27Q9GZN8 174 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R9Q9NYW1 312 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRH3Q9Y5N1 445 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 E9PLN8 166 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 UPK1AO00322 258 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX4O95219 450 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFI6P09912 130 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL8A1P27658 744 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK1P28482 360 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGDSP41222 190 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPB3Q12988 150 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMC4Q5J8M3 183 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP54Q7Z3B4 507 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPRGQ86SM5 289 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIX1Q8N485 282 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELP4Q96EB1 424 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35A4Q96G79 324 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 VKORC1Q9BQB6 163 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL7AQ9H8H3 244 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 QPCTLQ9NXS2 382 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms