RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF883P0CG24 379 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FOLR1P15328 257 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 XCR1P46094 333 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH3A2P51648 485 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ10P78508 379 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 HPCAP84074 193 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ID2Q02363 134 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP4K2Q12851 820 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EPS8Q12929 822 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LTB4RQ15722 352 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GPAT3Q53EU6 434 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC73Q6P1J9 531 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MED25Q71SY5 747 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT10Q86SR1 603 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7G2Q8NG99 324 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1L3Q8NH93 324 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RIT1Q92963 219 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TAMM41Q96BW9 452 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf34Q96L11 122 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1F2PQ96R84 312 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 BTBD2Q9BX70 525 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EQTNQ9NQ60 294 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 NCOR1O75376 2440 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PS29 197 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf72A4D263 438 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EI24O14681 340 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMDEC1O15204 470 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 COQ9O75208 318 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 HPRP00739 348 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OPN1SWP03999 348 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNW1P05000 195 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ALOX5P09917 674 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CSF2RBP32927 897 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MPLP40238 635 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GRK6P43250 576 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAN2A2P49641 1150 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 VLDLRP98155 873 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DAG1Q14118 895 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GK3PQ14409 553 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SYPL1Q16563 259 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LPAL2Q16609 132 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RFX4Q33E94 735 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PERM1Q5SV97 790 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SMYD1Q8NB12 490 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC9A6Q92581 669 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PMM1Q92871 262 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RDH12Q96NR8 316 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 COL21A1Q96P44 957 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DGAT2Q96PD7 388 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7D2Q96RA2 312 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PIGUQ9H490 435 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GIN1Q9NXP7 522 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 U3KQA8 63 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNA1EQ15878 2313 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PQM1 296 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DSCR3O14972 297 aa9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms