RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 AGAP5A6NIR3 686 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SGCEO43556 437 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 DUX1O43812 170 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PTP4A3O75365 173 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 UBXN7O94888 489 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 INMTO95050 263 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PLATP00750 562 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CDK1P06493 297 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 IL7RP16871 459 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SOX6P35712 828 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 RAB8AP61006 207 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 NCS1P62166 190 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 LIPEQ05469 1076 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PIGFQ07326 219 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 RCAN2Q14206 197 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF124Q15973 351 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 HES5Q5TA89 166 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM65Q6PI78 240 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 KRT73Q86Y46 540 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 LAS2Q8IYD9 372 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 OR2T12Q8NG77 320 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 MUS81Q96NY9 551 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ALG2Q9H553 416 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ICKQ9UPZ9 632 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 U3KQV3 271 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 H7C2Y5 167 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 FCER2P06734 321 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SDC1P18827 310 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CPN2P22792 545 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CRATP43155 626 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CSNK1G2P78368 415 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 REEP5Q00765 189 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 TTC23Q5W5X9 447 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 COL26A1Q96A83 441 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 COPS4Q9BT78 406 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 KCNH6Q9H252 994 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PDE7BQ9NP56 450 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 SCN3BQ9NY72 215 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 PHF11Q9UIL8 331 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 MKLN1Q9UL63 735 aa7.27□□□□□ -1.24
SLC13A3-202ENST00000290317 CACNA1EQ15878 2313 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 YY2O15391 372 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 PPP2R1BP30154 601 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CNR2P34972 360 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 POU4F3Q15319 338 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ARL14Q8N4G2 192 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 WDR20Q8TBZ3 569 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MTERF3Q96E29 417 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ASIC5Q9NY37 505 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 LMO7DNF2Z398 122 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 M0R296 226 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 WWP2O00308 870 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC13A3-202ENST00000290317 ACOT8O14734 319 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms