RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 DECR1Q16698 335 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 Q8N402 240 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GPR151Q8TDV0 419 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MTG2Q9H4K7 406 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RNF121Q9H920 327 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KCNK12Q9HB15 430 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KCNK6Q9Y257 313 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM129A0AVI4 362 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 UBXN7O94888 489 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF234Q14588 700 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 INAVAQ3KP66 663 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IRAK3Q9Y616 596 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 M0R129 80 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PLPP1O14494 284 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GREM1O60565 184 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IFNA16P05015 189 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GSTT2BP0CG30 244 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CST6Q15828 149 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SNX18Q96RF0 628 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SERINC2Q96SA4 455 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF559Q9BR84 538 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MED18Q9BUE0 208 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MARCH7Q9H992 704 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 WDR70Q9NW82 654 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LRRC72A6NJI9 287 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SSNA1O43805 119 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ARL4DP49703 201 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RAB8AP61006 207 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C12orf73Q69YU5 71 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR10G6Q8NH81 332 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SNX33Q8WV41 574 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RFT1Q96AA3 541 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CTDSP2O14595 271 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TSC22D2O75157 780 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2ABP04908 130 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CPEP16870 476 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 WASP42768 502 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GPR68Q15743 365 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SYPL1Q16563 259 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CCDC190Q86UF4 302 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR8K5Q8NH50 307 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TANKQ92844 425 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FOXJ1Q92949 421 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OBP2AQ9NY56 170 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF879B4DU55 563 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IFI30P13284 250 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 EPHA2P29317 976 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PRKAR1BP31321 381 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 AKT2P31751 481 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BSGP35613 385 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 DDOSTP39656 456 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms