RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040584.5

HOXC8-201, Transcript of homeobox C8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC8, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8-201ENST00000040584 NTRK1P04629 796 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MOGQ16653 247 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CPZQ66K79 652 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 SPARTQ8N0X7 666 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DEFB124Q8NES8 71 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 BORCS5Q969J3 196 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF304Q9HCX3 659 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 OR2W5A6NFC9 320 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PROB1E7EW31 1015 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DPM1O60762 260 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 B4GALT2O60909 372 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 JRKO75564 520 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MPIP34949 423 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 XCR1P46094 333 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ISL1P61371 349 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 FBLIM1Q8WUP2 373 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 M0QX08 132 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DLL1O00548 723 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 GPR75O95800 540 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 UQCRC2P22695 453 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 GPC1P35052 558 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MVDP53602 400 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CXCR4P61073 352 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 VEZF1Q14119 521 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 IL11RAQ14626 422 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 VMACQ2NL98 169 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 XAF1Q6GPH4 301 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DHRS13Q6UX07 377 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 OR2T29Q8NH02 315 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 FGF5P12034 268 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CPMP14384 443 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 IST1P53990 364 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CASP9P55211 416 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MC2RQ01718 297 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CD47Q08722 323 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DSG2Q14126 1118 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 KEAP1Q14145 624 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 LTB4RQ15722 352 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 FNDC8Q8TC99 324 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CMKLR1Q99788 373 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PALMDQ9NP74 551 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 GALNT8Q9NY28 637 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF292O60281 2723 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PFDN1O60925 122 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 FHP07954 510 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ITIH1P19827 911 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MATN1P21941 496 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 STT3AP46977 705 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 BTG2P78543 158 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 NFATC3Q12968 1075 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 SLC13A2Q13183 592 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 RGNQ15493 299 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 CHST8Q9H2A9 424 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 BCL10O95999 233 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 KDELR2P33947 212 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 ENTPD1P49961 510 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC8-201ENST00000040584 MEP1AQ16819 746 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms