RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 SHISA5Q8N114 240 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 PARP8Q8N3A8 854 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 OR6T1Q8NGN1 323 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 DSPPQ9NZW4 1301 aa22.41■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 E9PQ18 207 aa22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 PDX1P52945 283 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 P3H2Q8IVL5 708 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ENTHD1Q8IYW4 607 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 PDE7BQ9NP56 450 aa22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 A4GNTQ9UNA3 340 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 SYT5O00445 386 aa22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 OR10H2O60403 315 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 PLOD3O60568 738 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAP00813 363 aa22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 PIGFQ07326 219 aa22.4■■□□□ 1.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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RPUSD1-201ENST00000007264 HTR1AP08908 422 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ALOX5P09917 674 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 DMWDQ09019 674 aa22.39■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FHL5Q5TD97 284 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 VRK2Q86Y07 508 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.39■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF675Q8TD23 568 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 UBE2FQ969M7 185 aa22.39■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 RBCK1Q9BYM8 510 aa22.39■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 MKLN1Q9UL63 735 aa22.39■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.38■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZG16BQ96DA0 208 aa22.38■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.38■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 EPHA6Q9UF33 1036 aa22.38■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF6Q9Y252 685 aa22.38■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.38■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 HYKKA2RU49 373 aa22.38■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC35E2P0CK97 266 aa22.38■■□□□ 1.17
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 TPST2O60704 377 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT20P35900 424 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM53BQ14153 422 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 TCTE1Q5JU00 501 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR107Q5VW38 600 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.37■■□□□ 1.17
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC7A13Q8TCU3 470 aa22.37■■□□□ 1.17
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