RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TUBB	P07437	444 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FGF5	P12034	268 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PTPN3	P26045	913 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MAN1A1	P33908	653 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CAPZB	P47756	277 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CTSC	P53634	463 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	UBASH3A	P57075	661 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TUBB4B	P68371	445 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	AP1B1	Q10567	949 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	OLIG2	Q13516	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MESD	Q14696	234 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PDK2	Q15119	407 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	COG8	Q96MW5	612 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CHP1	Q99653	195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	CARD9	Q9H257	536 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	PDZD2	O15018	2839 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS11-208	ENST00000559557	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A0G2JNG1	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PYGL	P06737	847 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	INHBA	P08476	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	KRT7	P08729	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	G6PD	P11413	515 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	FOLR1	P15328	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ITGA2	P17301	1181 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	S1PR1	P21453	382 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	NFKBIA	P25963	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	DLST	P36957	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CDKN2B	P42772	138 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	DYNLT1	P63172	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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