RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 HNF1AP20823 631 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CYP2A7P20853 494 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ACP1P24666 158 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ADRA1DP25100 572 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CD38P28907 300 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ACTR1BP42025 376 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PRIM2P49643 509 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DGKQP52824 942 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 YPEL5P62699 121 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CCZ1BP86790 482 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MC1RQ01726 317 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PPP3CAQ08209 521 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LLGL1Q15334 1064 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KCTD11Q693B1 232 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MED25Q71SY5 747 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SSX9Q7RTT3 188 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ACOT1Q86TX2 421 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CPXM2Q8N436 756 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 UFD1Q92890 307 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MRI1Q9BV20 369 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DUSP26Q9BV47 211 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SDCBP2Q9H190 292 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 OR51M1Q9H341 326 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GDF3Q9NR23 364 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SNX15Q9NRS6 342 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SH3BP4Q9P0V3 963 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 APPL1Q9UKG1 709 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ASB4Q9Y574 426 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.35□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RP1P56715 2156 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 A0A1W2PR77 199 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 A4D1N5 150 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GMNCA6NCL1 334 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LDLRAD4O15165 306 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 HS6ST1O60243 411 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TSPAN2O60636 221 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 BMP15O95972 392 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 IFNA4P05014 189 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 LCKP06239 509 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TPOP07202 933 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 COX4I1P13073 169 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PRF1P14222 555 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FDXRP22570 491 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CXCR5P32302 372 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CASP3P42574 277 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PMP22Q01453 160 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 NPRL3Q12980 569 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PRKAA1Q13131 559 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TTI2Q6NXR4 508 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SCD5Q86SK9 330 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DENND1CQ8IV53 801 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 TEX12Q9BXU0 123 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 RAB17Q9H0T7 212 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MAGEH1Q9H213 219 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-212ENST00000535535 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.34□□□□□ -1.23
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