RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 BTN3A2P78410 334 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TLE4Q04727 773 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ACAP2Q15057 778 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 XKR6Q5GH73 641 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM45BPQ6NSW5 357 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 C3P1Q6ZMU1 363 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 EID3Q8N140 333 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D19Q8N5T2 526 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GNT7Q8NFL0 401 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CERS2Q96G23 380 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 AIF1LQ9BQI0 150 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NT5DC2Q9H857 520 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 DEPPQ9NTK1 212 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MKS1Q9NXB0 559 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS13CQ709C8 3753 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CACNA1CQ13936 2221 aa5.89□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SCN3AQ9NY46 2000 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1B0GVC2 190 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PINLYPA6NC86 204 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 A8MUA0 341 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 FCHO1O14526 889 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HS6ST1O60243 411 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MYO1DO94832 1006 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GLSO94925 669 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHG3P01860 377 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPIND1P05546 499 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GSTM2P28161 218 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP2R1BP30154 601 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GGT5P36269 586 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RFC3P40938 356 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HNF4AP41235 474 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ELK3P41970 407 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC6A9P48067 706 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HNMTP50135 292 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 E2F2Q14209 437 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CEP97Q8IW35 865 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF595Q8IYB9 648 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 GPATCH11Q8N954 259 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TTLQ8NG68 377 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NRG4Q8WWG1 115 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB5Q8WWX0 329 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 NCLNQ969V3 563 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZG16BQ96DA0 208 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC39Q96DD0 335 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 VMP1Q96GC9 406 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 UCK2Q9BZX2 261 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 COQ3Q9NZJ6 369 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF6Q9Y252 685 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 OARD1Q9Y530 152 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 PSAT1Q9Y617 370 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 ACANP16112 2415 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF40A-210ENST00000489741 E7ESA3 106 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms