RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474699.1

TIA1-209, Transcript of TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein, human

TSL 2

Gene TIA1, Length 686 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIA1-209	ENST00000474699	GRIA1	P42261	906 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	DCDC1	P59894	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PLD1	Q13393	1074 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	FHL1	Q13642	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SQLE	Q14534	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SSX2	Q16385	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	COQ2	Q96H96	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	HACD3	Q9P035	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ADCY9	O60503	1353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	TNR	Q92752	1358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SH2D1B	O14796	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ARPC3	O15145	178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	OR1F1	O43749	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	AGT	P01019	485 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	UMOD	P07911	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SLC2A3	P11169	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	LIF	P15018	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	NT5E	P21589	574 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	NDST1	P52848	882 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PRMT2	P55345	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	P2RY14	Q15391	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	C3AR1	Q16581	482 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	CDKN3	Q16667	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	DUSP5	Q16690	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	NPY6R	Q99463	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIA1-209	ENST00000474699	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.53	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699		A0A087WZ39	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699		A0A1W2PS18	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	KLF11	O14901	512 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	KIAA0513	O60268	411 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	FCMR	O60667	390 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	NEBL	O76041	1014 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	IGHE	P01854	428 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	FCER2	P06734	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	FGF4	P08620	206 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	FCGR1A	P12314	374 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	CPN1	P15169	458 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	AMD1	P17707	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	AADAC	P22760	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TIA1-209	ENST00000474699	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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