RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP10O43572 662 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZG16O60844 167 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX11AO75192 247 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CRCPO75575 148 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 AGFG2O95081 481 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CT45A8P0DMV1 189 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CT45A9P0DMV2 189 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 DDCP20711 480 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA5P43359 124 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA20P61599 178 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNTL6Q49A17 601 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf17Q53FE4 359 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OPN5Q6U736 354 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC15A4Q8N697 577 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF675Q8TD23 568 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HGDQ93099 445 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PGM2Q96G03 612 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ART5Q96L15 291 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TRMOQ9BU70 441 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MYNNQ9NPC7 610 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PNPOQ9NVS9 261 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 EHD3Q9NZN3 535 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SENP1Q9P0U3 644 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TINAGQ9UJW2 476 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MPDZO75970 2070 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRK2Q5S007 2527 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GTH9 108 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC151A5D8V7 595 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 UPK1AO00322 258 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS14O43566 566 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN2O60636 221 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT2B11O75310 529 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 GUCY1B2O75343 617 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BCKDHAP12694 445 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCD3P28288 659 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 MC3RP41968 323 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CA7P43166 264 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC1A6P48664 564 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CORO7P57737 925 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 BST1Q10588 318 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE7AQ13946 482 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 CASP8Q14790 479 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-206ENST00000461017 TTMPQ5BVD1 217 aa6.43□□□□□ -1.38
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