RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 PAQR7Q86WK9 346 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 OR9A2Q8NGT5 310 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GPA33Q99795 319 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 HHATLQ9HCP6 504 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 KLF15Q9UIH9 416 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 MKLN1Q9UL63 735 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 EPOPA6NHQ4 379 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SYT5O00445 386 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ASNA1O43681 348 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 PRKYO43930 277 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CSO75390 466 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 EML2O95834 649 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 MPIP34949 423 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 KIAA1024LP59773 190 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 DNASE1L3Q13609 305 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 NUP43Q8NFH3 380 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 RNF217Q8TC41 542 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ELP4Q96EB1 424 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CLEC2DQ9UHP7 191 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 A0A1W2PQF6 199 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ADAM23O75077 832 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GPX5O75715 221 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 COL9A1P20849 921 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 PCYT1AP49585 367 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 PRKCDQ05655 676 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 NRROSQ86YC3 692 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 LCN9Q8WX39 176 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 FGF11Q92914 225 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GAL3ST3Q96A11 431 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ISPDA4D126 451 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 POM121BA6NF01 834 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CKMT1AP12532 417 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CDK5Q00535 292 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 INAVAQ3KP66 663 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 LYSMD2Q8IV50 215 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SLC34A3Q8N130 599 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GIMAP5Q96F15 307 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ARHGDIGQ99819 225 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 MND1Q9BWT6 205 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 FBRSQ9HAH7 460 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CFL2Q9Y281 166 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 BTN3A3O00478 584 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 NR2F6P10588 404 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 S100A5P33763 92 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GIPRP48546 466 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 BTN3A2P78410 334 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 EFNB1P98172 346 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF45Q02386 682 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 TGM3Q08188 693 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 GINS1Q14691 196 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SPHARQ15513 63 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 SLC22A16Q86VW1 577 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 KCT2Q8NC54 265 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 ASB12Q8WXK4 309 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 C10orf90Q96M02 699 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 EQTNQ9NQ60 294 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN9-201ENST00000445369 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms