RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GDF1P27539 372 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCD3P28288 659 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DUSP2Q05923 314 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MGAT2Q10469 447 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXO1Q12778 655 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOMM20Q15388 145 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WLSQ5T9L3 541 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KAT2AQ92830 837 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OMA1Q96E52 524 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RILPQ96NA2 401 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MECRQ9BV79 373 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CENPHQ9H3R5 247 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF639Q9UID6 485 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FRG2CA6NGY1 282 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AQP7O14520 342 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUSD5O60279 629 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLDN14O95500 239 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CBX7O95931 251 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHG3P01860 377 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DRD5P21918 477 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HTR1EP28566 365 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERPINB5P36952 375 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPICP45877 212 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSPHP78330 225 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRILQ7L0X0 811 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MREGQ8N565 214 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.91□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 REM1O75628 298 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAPPC6AO75865 159 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLITRK5O94991 958 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CELA3AP09093 270 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC00032P0C843 101 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYZAPP0CAP1 466 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRPH2P23942 346 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL12BP29460 328 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GCKP35557 465 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EMDP50402 254 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GALNTL6Q49A17 601 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GXYLT1Q4G148 440 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KANK2Q63ZY3 851 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACAD11Q709F0 780 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CROCCP2Q86T23 111 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AGR3Q8TD06 166 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RND1Q92730 232 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMCO6Q96DC7 493 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALKBH4Q9NXW9 302 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.9□□□□□ -0.02
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1B0GVC2 190 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLOD3O60568 738 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCB7O75027 752 aa14.89□□□□□ -0.03
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHRNGP07510 517 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms