RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 AQP12BA6NM10 295 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ARPC2O15144 300 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 GSTA4O15217 222 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 FGF17O60258 216 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 CTNSO60931 367 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 PDX1P52945 283 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 RUNX1T1Q06455 604 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 STX4Q12846 297 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC13A2Q13183 592 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 TP53BP2Q13625 1128 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SERTAD2Q14140 314 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 RGNQ15493 299 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 STK11Q15831 433 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 STPG1Q5TH74 334 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SAXO2Q658L1 398 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 CPZQ66K79 652 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 AAGABQ6PD74 315 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SZRD1Q7Z422 152 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 GLRX5Q86SX6 157 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SPATA24Q86W54 205 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 BMPERQ8N8U9 685 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 UCN3Q969E3 161 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC35B4Q969S0 331 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 PROB1E7EW31 1015 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 FAM227AF5H4B4 570 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 EMC8O43402 210 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 OR10H2O60403 315 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 LDB3O75112 727 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 DNAJB6O75190 326 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ATP6V1G2O95670 118 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC35E2P0CK97 266 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 BMP2P12643 396 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 GGT1P19440 569 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 TGM1P22735 817 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 CRATP43155 626 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 HAAOP46952 286 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 OR1D4P47884 311 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 GSK3AP49840 483 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 POLE2P56282 527 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 OR4D2P58180 307 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 RAB15P59190 212 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MS4A2Q01362 244 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MC2RQ01718 297 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 RBBP4Q09028 425 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 CCNIQ14094 377 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 VEZF1Q14119 521 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 VMACQ2NL98 169 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 TMEM107Q6UX40 140 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 PIP4P1Q86T03 277 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 RNF130Q86XS8 419 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 HIPK4Q8NE63 616 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF675Q8TD23 568 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 NCLNQ969V3 563 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ELP4Q96EB1 424 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 CITED4Q96RK1 184 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 TRIM4Q9C037 500 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.99□□□□□ -1.29
HIVEP1-202ENST00000399469 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms