RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 OR2T3Q8NH03 318 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 LRRC15Q8TF66 581 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GGHQ92820 318 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MED8Q96G25 268 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 WBP1Q96G27 269 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PCED1BQ96HM7 432 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 OMDQ99983 421 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TPPP3Q9BW30 176 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TRIM4Q9C037 500 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DCLK3Q9C098 648 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MIS12Q9H081 205 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ACTL8Q9H568 366 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SGK2Q9HBY8 427 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 KLK4Q9Y5K2 254 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 EML5Q05BV3 1969 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ACACAQ13085 2346 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ZNF233A6NK53 670 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GMFGO60234 142 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 JAK2O60674 1132 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 WISP2O76076 250 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 BMP15O95972 392 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 KRT8P05787 483 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 S1PR1P21453 382 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 JAK1P23458 1154 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MPGP29372 298 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SSTR1P30872 391 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ARRB2P32121 409 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 AMTP48728 403 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PDX1P52945 283 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ACTR1AP61163 376 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CX3CL1P78423 397 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 KLC1Q07866 573 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ABRQ12979 859 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MYBPHQ13203 477 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 DNAJC3Q13217 504 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PHKG1Q16816 387 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TRNP1Q6NT89 227 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 LGI2Q8N0V4 545 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GPD1LQ8N335 351 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 OR13J1Q8NGT2 312 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 IRGQQ8WZA9 623 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ESAMQ96AP7 390 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ULK4Q96C45 1275 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 MTBPQ96DY7 904 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SGK494Q96LW2 274 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ERP44Q9BS26 406 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TM9SF3Q9HD45 589 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GDAP2Q9NXN4 497 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 C1RLQ9NZP8 487 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SCML1Q9UN30 329 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CACNA1EQ15878 2313 aa5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 TCHHQ07283 1943 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 A0A1B0GTQ1 180 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8IPA6NC78 632 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 ANTXRLA6NF34 631 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 LILRA5A6NI73 299 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 GOLGA8JA6NMD2 632 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 WASH3PC4AMC7 463 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 E5RJQ4 531 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 PSMD3O43242 534 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 SPRY3O43610 288 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CTDNEP1O95476 244 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 HMBSP08397 361 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FAM106CPP0CH98 169 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 CKMT2P17540 419 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FUT1P19526 365 aa5.03□□□□□ -1.6
CCL20-201ENST00000358813 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms