RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TGM5O43548 720 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 VEGFDO43915 354 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 GDF1P27539 372 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 XCR1P46094 333 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 RUNX2Q13950 521 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 RCAN2Q14206 197 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 IGDCC3Q8IVU1 814 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 KCNN1Q92952 543 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 ZNF681Q96N22 645 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 OR5B12Q96R08 314 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CRB3Q9BUF7 120 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 KATNBL1Q9H079 304 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 GCH1P30793 250 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CDKN2DP55273 166 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 ZNF33BQ06732 778 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CREBZFQ9NS37 354 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 LRFN1Q9P244 771 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.07□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PPW3 197 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 DFNA5O60443 496 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SCGB2A1O75556 95 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 ARAFP10398 606 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 HK3P52790 923 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PRMT2P55345 433 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 MFSD5Q6N075 450 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PMM2O15305 246 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 FOLR3P41439 243 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 XKR5Q6UX68 686 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SERPINA12Q8IW75 414 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 LINC00471Q8N535 108 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 TTC9BQ8N6N2 239 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 C17orf50Q8WW18 174 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 IGSF21Q96ID5 467 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 MTG2Q9H4K7 406 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CLN5O75503 358 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 IQCF3P0C7M6 154 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 TIMP2P16035 220 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 TRIM61Q5EBN2 209 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 UEVLDQ8IX04 471 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 POC1BQ8TC44 478 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 UBXN10Q96LJ8 280 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 YES1P07947 543 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 EBLN1P0CF75 366 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 NDUFV2P19404 249 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CRHBPP24387 322 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 FGL1Q08830 312 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 RUNX3Q13761 415 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 DHCR24Q15392 516 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 NR0B2Q15466 257 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 NKAIN2Q5VXU1 208 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 EID2Q8N6I1 236 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 MICU1Q9BPX6 476 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 RNF32Q9H0A6 362 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SLAMF7Q9NQ25 335 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PISDQ9UG56 409 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 OARD1Q9Y530 152 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PYCR1P32322 319 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CX3CR1P49238 355 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 SGSHP51688 502 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 DIO3P55073 304 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 FAM189BP81408 668 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PCLAFQ15004 111 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 CDONQ4KMG0 1287 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 FTMTQ8N4E7 242 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 BORCS7Q96B45 105 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 ZNF160Q9HCG1 818 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 DYNLRB1Q9NP97 96 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 PRAMEF11O60813 436 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 GCGRP47871 477 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 GRIN2CQ14957 1233 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 FIGLAQ6QHK4 219 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.06□□□□□ -0.8
CLN8-201ENST00000331222 RELL1Q8IUW5 271 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms