RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 GJA1P17302 382 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H2ADP20671 130 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 IRS1P35568 1242 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 DHODHQ02127 395 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 COQ8AQ8NI60 647 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 COMMD3Q9UBI1 195 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 HCN2Q9UL51 889 aa20.74■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GTQ1 180 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 RGS11O94810 467 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 PIK3CGP48736 1102 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 24.1
PITX1-201ENST00000265340 SLC6A19Q695T7 634 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 OR2T35Q8NGX2 323 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 MARK1Q9P0L2 795 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 MIOXQ9UGB7 285 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CARNS1A5YM72 827 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 TTLL8A6PVC2 850 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 WNT9AO14904 365 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 GLP2RO95838 553 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ABHD18Q0P651 414 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CHRNA6Q15825 494 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.73■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1024LP59773 190 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ERVK-25P63136 954 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 C10orf111Q8N326 155 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ALG14Q96F25 216 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 KCTD7Q96MP8 289 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 DBX1A6NMT0 343 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 SULT1C2O00338 296 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CCNB2O95067 398 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 GPR143P51810 404 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CAPZA1P52907 286 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 STX4Q12846 297 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 USP53Q70EK8 1073 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 OR4L1Q8NH43 312 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 GLYATL2Q8WU03 294 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 NUDT15Q9NV35 164 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 LHX3Q9UBR4 397 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 KLF15Q9UIH9 416 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 C5orf42Q9H799 3197 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 K7ERQ8 282 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 KDM4BO94953 1096 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 FBP1P09467 338 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 TSPAN5P62079 268 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 MAP4K2Q12851 820 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 OR1S1Q8NH92 325 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ9Q92806 393 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.71■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ACADLP28330 430 aa20.7■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 BDKRB1P46663 353 aa20.7■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 ARFIP1P53367 373 aa20.7■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 SERTAD2Q14140 314 aa20.7■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.7■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 C22orf42Q6IC83 251 aa20.7■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.7■□□□□ 0.91
PITX1-201ENST00000265340 PDZD9Q8IXQ8 264 aa20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms