RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-217	ENST00000583667	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CPN2	P22792	545 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NTS	P30990	170 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	KDELR2	P33947	212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PCGF2	P35227	344 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GCGR	P47871	477 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ALDH9A1	P49189	494 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GFER	P55789	205 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	KLRB1	Q12918	225 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SPIDR	Q14159	915 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	C18orf63	Q68DL7	685 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PISD	Q9UG56	409 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MTOR	P42345	2549 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667		H0YJX3	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	FOXS1	O43638	330 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	STATH	P02808	62 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NCK1	P16333	377 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	RAB38	P57729	211 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	BIK	Q13323	160 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GRM7	Q14831	915 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	UCN3	Q969E3	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	YY1AP1	Q9H869	796 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	HYKK	A2RU49	373 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PRSS23	O95084	383 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CPNE6	O95741	557 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	GPR75	O95800	540 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	C1QC	P02747	245 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	JMJD7	P0C870	316 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	RAP2A	P10114	183 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ARAF	P10398	606 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ITIH1	P19827	911 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	FAS	P25445	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PPP2R1B	P30154	601 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CSF2RB	P32927	897 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	FIG4	Q92562	907 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PYURF	Q96I23	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	PKP2	Q99959	881 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	STRADB	Q9C0K7	418 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-217	ENST00000583667	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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