RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 HCFC1P51610 2035 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 BICDL2A1A5D9 508 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 K7ERI5 159 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 BCL2L11O43521 198 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 SSX5O60225 188 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 PRPSAP2O60256 369 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 GPRIN2O60269 458 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 SH3BGRLO75368 114 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 IL10P22301 178 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF131P52739 623 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 SLC26A5P58743 744 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 GSTO1P78417 241 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 C15orf32Q32M92 178 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM26Q6ZUK4 368 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa3.46□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 RASGRF2O14827 1237 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 CFLARO15519 480 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 OR4F5Q8NH21 305 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 NLNQ9BYT8 704 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 AFF2P51816 1311 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1B0GVY2 172 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 MELTFP08582 738 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 CCNA2P20248 432 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 RPA1P27694 616 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM23P36406 574 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 ELK3P41970 407 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 MATKP42679 507 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-215ENST00000498284 MYBPC1Q00872 1141 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 HKDC1Q2TB90 917 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 KRT71Q3SY84 523 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 AGKQ53H12 422 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 VWA2Q5GFL6 755 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-215ENST00000498284 IL23RQ5VWK5 629 aa3.44□□□□□ -1.86
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