RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PPP3R2Q96LZ3 170 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 BBS4Q96RK4 519 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ANKRA2Q9H9E1 313 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 BCAP29Q9UHQ4 241 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 CFL2Q9Y281 166 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 RAP2CQ9Y3L5 183 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FLNCQ14315 2725 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ZGRF1Q86YA3 2104 aa19.33■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PINLYPA6NC86 204 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NPIPA5E9PKD4 350 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ATP6AP2O75787 350 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 CCL3P10147 92 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 BCKDHAP12694 445 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 CNR1P21554 472 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 RFC3P40938 356 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 EMDP50402 254 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 KCNK10P57789 538 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 C6orf136Q5SQH8 315 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 AGBL2Q5U5Z8 902 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 GFRALQ6UXV0 394 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 TMEM64Q6YI46 380 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FAM9CQ8IZT9 166 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 C17orf47Q8NEP4 570 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ARL8AQ96BM9 186 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ERP27Q96DN0 273 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 TSSK3Q96PN8 268 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SEC14L3Q9UDX4 400 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 HAO1Q9UJM8 370 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NPIPA1Q9UND3 350 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JMM0 328 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPB8 328 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRS3 328 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 KIR3DP1A8MWS1 328 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 UNC5CO95185 931 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 JUNP05412 331 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP19.31■□□□□ 0.685e-18■■□□□ 11.9
ACTB-211ENST00000480301 BST1Q10588 318 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 STX3Q13277 289 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NTRK2Q16620 822 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 OR2M7Q8NG81 312 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 OR7G2Q8NG99 324 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 CLHC1Q8NHS4 586 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 MGARPQ8TDB4 240 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PAQR8Q8TEZ7 354 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 GPR137Q96N19 417 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ITPAQ9BY32 194 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 GLIPR2Q9H4G4 154 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 REEP4Q9H6H4 257 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SACM1LQ9NTJ5 587 aa19.31■□□□□ 0.68
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ACTB-211ENST00000480301 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa19.31■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 G3V3Y1 287 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 AKAP10O43572 662 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PLOD3O60568 738 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 TBX19O60806 448 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 LRATO95237 230 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ZNF24P17028 368 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 RPL14P50914 215 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PDE7AQ13946 482 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 KRTCAP3Q53RY4 240 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A10Q63ZE4 541 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 OR10G3Q8NGC4 313 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 AMDHD1Q96NU7 426 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PRODH2Q9UF12 536 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ASNA1O43681 348 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NME6O75414 186 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 P04436 131 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 MAPK1P28482 360 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NTSP30990 170 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PIGAP37287 484 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ASMTP46597 345 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ZNF385BQ569K4 471 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 IL23RQ5VWK5 629 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 TUBGCP3Q96CW5 907 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 FAM173AQ9BQD7 235 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 C1orf50Q9BV19 199 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PROK2Q9HC23 129 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 PLOD2O00469 737 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 AGFG2O95081 481 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 STSP08842 583 aa19.28■□□□□ 0.68
ACTB-211ENST00000480301 ABCD3P28288 659 aa19.28■□□□□ 0.68
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