RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SSTR4P31391 388 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GFRA1P56159 465 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 NRG3P56975 720 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SLC37A1P57057 533 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TGM3Q08188 693 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SNX1Q13596 522 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 DOC2AQ14183 400 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GGTLC2Q14390 218 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CR1LQ2VPA4 569 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 MIDNQ504T8 468 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 GPSM1Q86YR5 675 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC89Q8N998 374 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ELOA3Q8NG57 546 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TTLQ8NG68 377 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RIT1Q92963 219 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FBXL8Q96CD0 374 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 NODALQ96S42 347 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PINK1Q9BXM7 581 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 LYRM4Q9HD34 91 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PAK5Q9P286 719 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 DKKL1Q9UK85 242 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SOX13Q9UN79 622 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OR6C76A6NM76 312 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 AP3B1O00203 1094 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SEC14L5O43304 696 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CDH16O75309 829 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 VENTXO95231 258 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC166P0CW27 439 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CNTFP26441 200 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SLC1A2P43004 574 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PGGT1BP53609 377 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 AP1S2P56377 157 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C21orf58P58505 322 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FGFBP1Q14512 234 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PON3Q15166 354 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RAB35Q15286 201 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TSC22D1Q15714 1073 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 NNATQ16517 81 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 LUZP1Q86V48 1076 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 KRT78Q8N1N4 520 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RNF122Q9H9V4 155 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 NGBQ9NPG2 151 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FANCFQ9NPI8 374 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 EHD3Q9NZN3 535 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 DYSFO75923 2080 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 CLGNO14967 610 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 LIASO43766 372 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RAMP1O60894 148 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PPM1BO75688 479 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 WDR47O94967 919 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-222ENST00000449504 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms