RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TRPC4Q9UBN4 977 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PRODH2Q9UF12 536 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF639Q9UID6 485 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF232Q9UNY5 417 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 AURKCQ9UQB9 309 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 IFT52Q9Y366 437 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC42Q9Y546 428 aa9□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 CLOCKO15516 846 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 B4GALT2O60909 372 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LDB3O75112 727 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 RFPL3O75679 317 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PRKD3O94806 890 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PGM3O95394 542 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINA1P01009 418 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LDLRP01130 860 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 CTSBP07858 339 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 OR12D1P0DN82 309 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TNNI3P19429 210 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LCN1P31025 176 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MAN2A2P49641 1150 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LIMK1P53667 647 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 DCAF7P61962 342 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SPEM2Q0P670 501 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MGAT2Q10469 447 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 FUT7Q11130 342 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TCF15Q12870 199 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 COX20Q5RI15 118 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 FHL5Q5TD97 284 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM107Q6UX40 140 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ANKFN1Q8N957 763 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 NR4A3Q92570 626 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TCEAL3Q969E4 200 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 NRBF2Q96F24 287 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF347Q96SE7 839 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 OR51I1Q9H343 314 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LANCL2Q9NS86 450 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SATB2Q9UPW6 733 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 NINQ8N4C6 2090 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 KNTC1P50748 2209 aa8.99□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 C4orf47A7E2U8 309 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 EFCAB7A8K855 629 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PROB1E7EW31 1015 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MEN1O00255 615 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF2O60811 474 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS23O95084 383 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MED26O95402 600 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 IFNA16P05015 189 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MAP3K8P41279 467 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MC3RP41968 323 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 OR1D4P47884 311 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 HSPA13P48723 471 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 KCNC4Q03721 635 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6AP1Q15904 470 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 PIP4P1Q86T03 277 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 SVOPLQ8N434 492 aa8.98□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 BMPERQ8N8U9 685 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms