RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 CSRP3P50461 194 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 CCL11P51671 97 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGDIAP52565 204 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 HERVK_113P63132 956 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ERVK-8P63133 956 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 NAAAQ02083 359 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 C17orf67Q0P5P2 114 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 COX10Q12887 443 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 OVGP1Q12889 678 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SNX1Q13596 522 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ABRAXAS2Q15018 415 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PCK2Q16822 640 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 MICAQ29983 383 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 EIPR1Q53HC9 387 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 NHLRC3Q5JS37 347 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC25A30Q5SVS4 291 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 LEMD1Q68G75 181 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF774Q6NX45 483 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TATDN1Q6P1N9 297 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 BNIPLQ7Z465 357 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 RABEPKQ7Z6M1 372 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 MARCH9Q86YJ5 346 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 FGFRL1Q8N441 504 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 OR4F5Q8NH21 305 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PHYHIPQ92561 330 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM45BQ96B21 275 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC28BQ9BUN5 200 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR174Q9BXC1 333 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ERVK-6Q9BXR3 956 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM9Q9C026 710 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 CXXC4Q9H2H0 198 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TNMDQ9H2S6 317 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM231Q9H6L2 316 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 IL1RL2Q9HB29 575 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF581Q9P0T4 197 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 EMCNQ9ULC0 261 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ODF2LQ9ULJ1 636 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF24Q9Y225 148 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 DHRS7Q9Y394 339 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF175Q9Y473 711 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 KIF7Q2M1P5 1343 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 FGD5Q6ZNL6 1462 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SALL1Q9NSC2 1324 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A0A6YYD4 124 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 RENP00797 406 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 MT-ATP6P00846 226 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 MT-ND3P03897 115 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 HCKP08631 526 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 FOLR2P14207 255 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ACP1P24666 158 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 ASMTP46597 345 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 NPY2RP49146 381 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TKTL1P51854 596 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 HMGCS2P54868 508 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PPIAP62937 165 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PRKCEQ02156 737 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SRYQ05066 204 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC10A1Q14973 349 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PARP6Q2NL67 630 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 HFEQ30201 348 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 MARC1Q5VT66 337 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 TAF3Q5VWG9 929 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 RAB12Q6IQ22 244 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 PLBD1Q6P4A8 553 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 OR52J3Q8NH60 311 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 LHX4Q969G2 390 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 SERAC1Q96JX3 654 aa2.29□□□□□ -2.04
SNORD3E-201ENST00000362899 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms